Grupy tematyczne Forum Młodych Dyplomatów skupiają członków, których łączy wspólne zainteresowanie konkretnym zagadnieniem lub obszarem. Obecnie, w ramach Forum Młodych Dyplomatów działa jedna grupa tematyczna: Grupa Tematyczna Bezpieczeństwa i Konfliktów Zbrojnych.

Grupa ta daje przestrzeń do wymiany poglądów i spostrzeżeń wszystkim zainteresowanym tematyką wyzwań w zakresie bezpieczeństwa międzynarodowego, przed którymi stoi współczesny świat. Działanie grupy tematycznej obejmuje m.in. analizy konfliktów zbrojnych, tematów związanych z cyberbezpieczeństwem i bezpieczeństwem energetycznym oraz żywnościowym. Prace grupy skupiają się także na analizie ról podmiotów niepaństwowych, sojuszy wojskowych oraz globalnego rynku handlu bronią w zakresie bezpieczeństwa międzynarodowego.